单细胞测序，单细解密小RNA分子的胞测未知功能

10月31日，Nature Biotechnology杂志发表了一篇关于单细胞测序技术计算小RNA转录组的序解文章，探索了小RNA在细胞发育中的知功功能。改方法有助于人们更好地理解基因如何调控不同细胞类型的单细发展，研究人员对新方法的胞测临床应用十分乐观。

随着科研人员对各种遗传疾病和癌症的序解深入挖掘，单细胞基因组方法捕获的知功信息变得越来越重要。卡罗林斯卡学院（ Karolinska Institute）的单细研究人员近日公布了一种新方法，这种方法可以读取个体胚胎干细胞中短的胞测、非编码RNA序列，序解有助于人们更好地理解基因如何调控不同细胞类型的知功发展。相关结果以《Single-Cell Sequencing of the Small-RNA Transcriptome》为题发表在Nature Biotechnology 杂志杂志上。单细

基因中的胞测信息首先被翻译成信使RNA（mRNA），mRNA也是序解构成蛋白质的蓝图。然而，除了mRNA，细胞中还含有非编码的、短的RNA序列，这些RNA不参与蛋白质的形成，且功能在很大程度上是未知的，其中最典型的是 microRNA（miRNA），它可以与mRNA相互作用从而调控基因的表达和细胞的功能。

“人们对短RNA分子功能的认识相当普遍，也了解它的一般机制，但人们尚不清楚这些分子在不同细胞或疾病中发挥的特殊作用。”卡罗林斯卡医学院细胞分子生物系高级研究员Rickard Sandberg博士解释说。

在本文中，研究人员对单细胞转录组进行分析，这种方法使得测量细胞内短RNA分子的绝对数量成为了可能，他们使用了两种类型的胚胎干细胞，旨在模拟早期胚胎附着到子宫内膜前后的状态。

作者写道，“我们发现了一种单细胞小RNA测序法，并将其应用至稚嫩的人类胚胎干细胞和癌细胞中。对miRNAs、tRNAs（转运RNA）和snoRNAs（小分子RNA）的分析表明miRNAs可能是不同细胞类型和状态的潜在标志。”

研究人员调查了两种细胞状态下小RNAs的分值，其中包括miRNA和很大程度上功能未知的短RNA片段（tRNAs和snoRNAs）。他们发现大量的miRNAs在两种细胞状态中的表达有差异。

本文作者Omid Faridani博士说，“这只是基础研究和示范方法，仍需开展进一步研究。绘制细胞中的短RNA分子是确定这些分子特定功能的第一步。”

研究人员对该结果很兴奋，对新方法的临床应用也十分乐观。“我们对短RNA分子在胚胎发育过程中扮演的角色很感兴趣，希望能有更多的研究证实这种方法可以用来筛选胚胎，以确定哪些胚胎的发育能力最强，这有利于改善目前的体外受精治疗。”Sandberg博士总结道。

备注：若对该研究感兴趣，可点击原文献《Single-Cell Sequencing of the Small-RNA Transcriptome》

(责任编辑：休闲)